Системная биология
Систе́мная биоло́гия — междисциплинарное научное направление, образовавшееся на стыке биологии и теории сложных систем, ориентированное на изучение сложных взаимодействий в живых системах. Впервые термин используется в статье 1993 года авторов W. Zieglgänsberger и TR. Tölle. Широкое распространение термин «системная биология» получил после 2000 года.
Формирует новый подход к интерпретации результатов в биологии 21-го века вместо традиционного для биологии прошлых столетий редукционизма, и такой новый подход в настоящее время обозначают терминами холизм[источник не указан 3293 дня] и англ. integrationism). Основное внимание в системной биологии уделяется так называемым эмерджентным свойствам, то есть свойствам биологических систем, которые невозможно объяснить только с точки зрения свойств её компонентов.
Понимание (англ. insight) биологии на системном уровне даёт возможность для более верного осмысления структуры, динамики и функций как отдельной клетки, так и организма в целом, чем при рассмотрении по-отдельности частей клетки или организма.
Системная биология тесно связана с математической биологией.
Значения
Системная биология может пониматься как:
- Область исследований, нацеленная на изучение взаимодействий между составляющими частями биологических систем и на исследование механизмов формирования функций и системных свойств в результате этих взаимодействий (например, взаимодействие метаболитов и ферментов в метаболических системах).
- Научная парадигма, противопоставляемая так называемой редукционистской парадигме в изучении сложных биологических систем, однако полностью соответствующая научному методу познания.
- Набор исследовательских протоколов, а именно, цикл исследований, состоящий из теории, аналитического или компьютерного моделирования для формулировки гипотез о системе, экспериментальной проверки, и затем использование полученных данных для описания клетки или клеточных процессов для улучшения компьютерной модели или теории. Поскольку целью является модель взаимодействий в сложной системе, экспериментальные методики, которые используются в системной биологии должны быть наиболее детальными. По этой причине для верификации моделей используются такие методики как транскриптомика, метаболомика, протеомика и другие высокопроизводительные технологии для сбора численных данных.
- Применение теории динамических систем к биологическим процессам.
- Соционаучный феномен, определяемый как стремление к интеграции сложных данных о взаимодействиях в биологических системах, полученных из различных экспериментальных источников, используя междисциплинарные методы.
Различие в понимании системной биологии объясняется тем фактом, что данное понятие относится скорее к совокупности пересекающихся концепций, чем к одному строго определенному направлению. Несмотря на различие в понимании целей и методов системной биологии, термин широко используется исследователями, в том числе как часть названий научных подразделений и целых институтов по всему миру.
История
Предпосылками появления системной биологии являются:
- Количественное моделирование ферментативной кинетики — направление, формировавшееся между 1900 и 1970 годами,
- Математическое моделирование роста популяций,
- Моделирование в нейрофизиологии,
- Теория динамических систем и кибернетика.
- Синергетика
Пионером системной биологии можно считать Людвига Фон Берталанфи, создателя общей теории систем, автора книги «Общая теория систем в физике и биологии», опубликованной в 1950 году. Одной из первых численных моделей в биологии является модель британских нейрофизиологов и лауреатов нобелевской премии Ходжкина и Хаксли, опубликованной в 1952 году. Авторы создали математическую модель, объясняющую распространение потенциала действия вдоль аксона нейрона. Их модель описывала механизм распространения потенциала как взаимодействие между двумя различными молекулярными компонентами: каналами для калия и натрия, что можно расценить как начало вычислительной системной биологии. В 1960 году на основе модели Ходжкина и Хаксли Денис Нобл создал первую компьютерную модель сердечного водителя ритма.
Формально первая работа по системной биологии, как самостоятельной дисциплине, была представлена системным теоретиком Михайло Месаровичем в 1966 году на международном симпозиуме в Институте технологии в Кливленде (США, штат Огайо) под названием «Системная теория и биология».
В 60-х, 70-х годах двадцатого века был разработан ряд подходов для изучения сложных молекулярных систем, таких как и . Успехи молекулярной биологии в 80-х годах при некотором спаде интереса к теоретической биологии вообще, которая обещала больше, чем смогла достичь, привели к падению интереса к моделированию биологических систем.
Тем не менее, рождение функциональной геномики в 1990-х годах привело к доступности большого количества данных высокого качества, что совместно с бумом в развитии вычислительной техники, позволило создавать более реалистичные модели. В 1997 году группа опубликовала первую численную модель метаболизма целой (гипотетической) клетки. Термин «системная биология» может быть также найден в статье В. Зиглгансберга и Т. Толле, опубликованной в 1993 году. В течение 1990-х годов Б. Зенг создал ряд концепций, моделей и терминов: системная медицина (апрель 1992), системная биоинженерия (июнь 1994) и системная генетика (ноябрь 1994).
В течение 2000-х годов, когда создавались институты системной биологии в Сиэтле и Токио, системная биология вступила в полные права, будучи вовлечённой в различные геномные проекты, обрабатывая и интерпретируя данные из «-омик» (протеомика, метаболомика), помогая в интерпретации прочих высокопроизводительных экспериментов, включая биоинформатику. По состоянию на лето 2006 года в связи с нехваткой системных биологов было создано несколько учебных центров по всему миру.
Важной вехой в становлении системной биологии стал международный проект Физиом.
Экспериментальные методы системной биологии
Для верификации создаваемых моделей в системной биологии используются различные типы экспериментальных данных, описывающих как отдельные составляющие, так и систему в целом. Зачастую в качестве исходной информации для формулировки гипотез и выводов используются данные, полученные в других областях биологии: биохимии, биофизики, молекулярной биологии. Тем не менее, существует ряд специфичных методов, прочно ассоциируемых с системной биологией. Эти методы характеризует большое количество экспериментальных измерений, а также одновременное детектирование многих характеристик, что стало возможным благодаря появлению автоматизированных потоковых методик экспериментов.
Примерами таких методов могут являться:
- Геномика: высокопроизводительные методы секвенирования ДНК, включая изучение в различных клетках одного организма.
- Эпигеномика/Эпигенетика: изучение факторов транскрипции, не кодируемых в ДНК (метилирование ДНК, и т. д.).
- Транскриптомика: измерение экспрессии генов, используя ДНК-микрочипы и другие методы.
- : измерение взаимодействия транскрибируемых РНК.
- Протеомика/: измерение уровня белков или пептидов с использованием двумерного гель-электрофореза, масс-спектрометрии или многомерных методик измерения белков.
- Метаболомика: измерение концентраций так называемых малых молекул, метаболитов.
- Гликомика: измерение уровня углеводов.
- : измерение уровня липидов.
Кроме представленных методов измерения уровня молекул, существуют также более сложные методы, позволяющие измерять динамику характеристик во времени и взаимодействие между компонентами:
- Интерактомика: измерение взаимодействий между молекулами (например, измерение белок-белковых взаимодействий: PPI).
- : измерение динамики потоков и концентраций во времени (как правило метаболитов).
- : системный анализ биома.
Многие перечисленные методики в настоящее время все ещё активно развиваются как в направлении увеличения точности и информативности измерений, так и в способах численной обработки получаемых данных.
Инструменты системной биологии
Исследования в области системной биологии чаще всего заключаются в разработке механистической модели сложной биологической системы, то есть модели, сконструированной на основе реальных данных об элементарных процессах, составляющих систему.
Метаболический или сигнальный путь может быть описан математически на основе теорий ферментативной или химической кинетики. Для анализа полученных систем могут применяться математические методы нелинейной динамики, теории случайных процессов, либо использоваться теория управления.
Из-за сложности объекта изучения, большого количества параметров, переменных и уравнений, описывающих биологическую систему, современная системная биология немыслима без использования компьютерных технологий. Компьютеры используются для решения систем нелинейных уравнений, изучения устойчивости и чувствительности системы, определения неизвестных параметров уравнений по экспериментальным данным. Новые компьютерные технологии оказывают существенное влияние на развитие системной биологии. В частности, использование исчисления процессов, автоматических средств поиска информации в публикациях, вычислительная лингвистика, разработка и наполнение общедоступных баз данных.
В рамках системной биологии ведётся работа над созданием собственных программных средств для моделирования и универсальных языков для хранения и аннотации моделей. В качестве примера можно привести , (расширения XML для записи моделей), а также SBGN (язык графического представления структуры взаимодействий элементов биологических систем).
См. также
- Смежные области
- Биоинформатика
- Биотехнология
- Биоинженерия
- Биостатистика
- Биофизика
- Биохимия
- Вычислительная биология
- Математическая биология
- Моделирование
- Синтетическая биология
- Теория функциональных систем
- Физиом
Примечания
- [1]Архивная копия от 1 июня 2016 на Wayback Machine The pharmacology of pain signalling. [Curr Opin Neurobiol. 1993] — PubMed result
- Peter Kohl, Denis Noble, Raimond L. Winslow & Peter J. Hunter. Computational modelling of biological systems: tools and visions (англ.) // Phil. Trans. R. Soc. Lond. A : журнал. — 2000. — Vol. 358, no. 1766. — P. 579—610. — ISSN 1364-503X. — doi:10.1098/rsta.2000.0547.
- Hiroaki Kitano. Systems Biology: A Brief Overview (англ.) // Science. — 2002. — 1 March (vol. 295). — P. 1662—1664. — doi:10.1126/science.1069492.
- Sauer, U. et al. Getting Closer to the Whole Picture (англ.) // Science. — 2007. — 27 April (vol. 316). — P. 550. — doi:10.1126/science.1142502. — PMID 17463274.
- Denis Noble. The Music of Life: Biology beyond the genome (англ.). — Oxford University Press, 2006. — ISBN 978-0199295739. p21
- Kholodenko B.N., Bruggeman F.J., Sauro H.M. (2005.). Mechanistic and modular approaches to modeling and inference of cellular regulatory networks. Systems Biology: Definitions and Perspectives. Springer-Verlag. p. 143.
{{cite conference}}: Проверьте значение даты:|date=(справка); Неизвестный параметр|coauthors=игнорируется (|author=предлагается) (справка)Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка) - Hodgkin A. L., Huxley A. F. A quantitative description of membrane current and its application to conduction and excitation in nerve (англ.) // [англ.] : journal. — 1952. — Vol. 117, no. 4. — P. 500—544. — PMID 12991237.
- Le Novere; Le Novere, N. The long journey to a Systems Biology of neuronal function (англ.) // [англ.] : journal. — 2007. — Vol. 1. — P. 28. — doi:10.1186/1752-0509-1-28. — PMID 17567903.
- Noble D. Cardiac action and pacemaker potentials based on the Hodgkin-Huxley equations (англ.) // Nature : journal. — 1960. — Vol. 188. — P. 495—497. — doi:10.1038/188495b0. — PMID 13729365.
- [англ.]. Systems Theory and Biology (неопр.). — Springer-Verlag, 1968.
- A Means Toward a New Holism (англ.) // Science. — Vol. 161, no. 3836. — P. 34—35. — doi:10.1126/science.161.3836.34.
- Working the Systems. Дата обращения: 4 февраля 2010. Архивировано из оригинала 16 апреля 2012 года.
- Gardner, TS; di Bernardo D., Lorenz D and Collins J. J. Inferring genetic networks and identifying compound of action via expression profiling (англ.) // Science : journal. — 2003. — 4 July (vol. 301). — P. 102—1005. — doi:10.1126/science.1081900. — PMID 12843395.
- di Bernardo, D; Thompson M. J., Gardner T. S., Chobot S. E., Eastwood E. L., Wojtovich A. P., Elliot S. J., Schaus SE and Collins J. J. Chemogenomic profiling on a genome-wide scale using reverse-engineered gene networks (англ.) // Nature Biotechnology : journal. — Nature Publishing Group, 2005. — March (vol. 23). — P. 377—383. — doi:10.1038/nbt1075. — PMID 15765094.
Википедия, чтение, книга, библиотека, поиск, нажмите, истории, книги, статьи, wikipedia, учить, информация, история, скачать, скачать бесплатно, mp3, видео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, картинка, музыка, песня, фильм, игра, игры, мобильный, телефон, Android, iOS, apple, мобильный телефон, Samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Сеть, компьютер, Информация о Системная биология, Что такое Системная биология? Что означает Системная биология?
Siste mnaya biolo giya mezhdisciplinarnoe nauchnoe napravlenie obrazovavsheesya na styke biologii i teorii slozhnyh sistem orientirovannoe na izuchenie slozhnyh vzaimodejstvij v zhivyh sistemah Vpervye termin ispolzuetsya v state 1993 goda avtorov W Zieglgansberger i TR Tolle Shirokoe rasprostranenie termin sistemnaya biologiya poluchil posle 2000 goda Formiruet novyj podhod k interpretacii rezultatov v biologii 21 go veka vmesto tradicionnogo dlya biologii proshlyh stoletij redukcionizma i takoj novyj podhod v nastoyashee vremya oboznachayut terminami holizm istochnik ne ukazan 3293 dnya i angl integrationism Osnovnoe vnimanie v sistemnoj biologii udelyaetsya tak nazyvaemym emerdzhentnym svojstvam to est svojstvam biologicheskih sistem kotorye nevozmozhno obyasnit tolko s tochki zreniya svojstv eyo komponentov Ponimanie angl insight biologii na sistemnom urovne dayot vozmozhnost dlya bolee vernogo osmysleniya struktury dinamiki i funkcij kak otdelnoj kletki tak i organizma v celom chem pri rassmotrenii po otdelnosti chastej kletki ili organizma Sistemnaya biologiya tesno svyazana s matematicheskoj biologiej ZnacheniyaSistemnaya biologiya mozhet ponimatsya kak Oblast issledovanij nacelennaya na izuchenie vzaimodejstvij mezhdu sostavlyayushimi chastyami biologicheskih sistem i na issledovanie mehanizmov formirovaniya funkcij i sistemnyh svojstv v rezultate etih vzaimodejstvij naprimer vzaimodejstvie metabolitov i fermentov v metabolicheskih sistemah Nauchnaya paradigma protivopostavlyaemaya tak nazyvaemoj redukcionistskoj paradigme v izuchenii slozhnyh biologicheskih sistem odnako polnostyu sootvetstvuyushaya nauchnomu metodu poznaniya Nabor issledovatelskih protokolov a imenno cikl issledovanij sostoyashij iz teorii analiticheskogo ili kompyuternogo modelirovaniya dlya formulirovki gipotez o sisteme eksperimentalnoj proverki i zatem ispolzovanie poluchennyh dannyh dlya opisaniya kletki ili kletochnyh processov dlya uluchsheniya kompyuternoj modeli ili teorii Poskolku celyu yavlyaetsya model vzaimodejstvij v slozhnoj sisteme eksperimentalnye metodiki kotorye ispolzuyutsya v sistemnoj biologii dolzhny byt naibolee detalnymi Po etoj prichine dlya verifikacii modelej ispolzuyutsya takie metodiki kak transkriptomika metabolomika proteomika i drugie vysokoproizvoditelnye tehnologii dlya sbora chislennyh dannyh Primenenie teorii dinamicheskih sistem k biologicheskim processam Socionauchnyj fenomen opredelyaemyj kak stremlenie k integracii slozhnyh dannyh o vzaimodejstviyah v biologicheskih sistemah poluchennyh iz razlichnyh eksperimentalnyh istochnikov ispolzuya mezhdisciplinarnye metody Razlichie v ponimanii sistemnoj biologii obyasnyaetsya tem faktom chto dannoe ponyatie otnositsya skoree k sovokupnosti peresekayushihsya koncepcij chem k odnomu strogo opredelennomu napravleniyu Nesmotrya na razlichie v ponimanii celej i metodov sistemnoj biologii termin shiroko ispolzuetsya issledovatelyami v tom chisle kak chast nazvanij nauchnyh podrazdelenij i celyh institutov po vsemu miru IstoriyaPredposylkami poyavleniya sistemnoj biologii yavlyayutsya Kolichestvennoe modelirovanie fermentativnoj kinetiki napravlenie formirovavsheesya mezhdu 1900 i 1970 godami Matematicheskoe modelirovanie rosta populyacij Modelirovanie v nejrofiziologii Teoriya dinamicheskih sistem i kibernetika Sinergetika Pionerom sistemnoj biologii mozhno schitat Lyudviga Fon Bertalanfi sozdatelya obshej teorii sistem avtora knigi Obshaya teoriya sistem v fizike i biologii opublikovannoj v 1950 godu Odnoj iz pervyh chislennyh modelej v biologii yavlyaetsya model britanskih nejrofiziologov i laureatov nobelevskoj premii Hodzhkina i Haksli opublikovannoj v 1952 godu Avtory sozdali matematicheskuyu model obyasnyayushuyu rasprostranenie potenciala dejstviya vdol aksona nejrona Ih model opisyvala mehanizm rasprostraneniya potenciala kak vzaimodejstvie mezhdu dvumya razlichnymi molekulyarnymi komponentami kanalami dlya kaliya i natriya chto mozhno rascenit kak nachalo vychislitelnoj sistemnoj biologii V 1960 godu na osnove modeli Hodzhkina i Haksli Denis Nobl sozdal pervuyu kompyuternuyu model serdechnogo voditelya ritma Formalno pervaya rabota po sistemnoj biologii kak samostoyatelnoj discipline byla predstavlena sistemnym teoretikom Mihajlo Mesarovichem v 1966 godu na mezhdunarodnom simpoziume v Institute tehnologii v Klivlende SShA shtat Ogajo pod nazvaniem Sistemnaya teoriya i biologiya V 60 h 70 h godah dvadcatogo veka byl razrabotan ryad podhodov dlya izucheniya slozhnyh molekulyarnyh sistem takih kak i Uspehi molekulyarnoj biologii v 80 h godah pri nekotorom spade interesa k teoreticheskoj biologii voobshe kotoraya obeshala bolshe chem smogla dostich priveli k padeniyu interesa k modelirovaniyu biologicheskih sistem Tem ne menee rozhdenie funkcionalnoj genomiki v 1990 h godah privelo k dostupnosti bolshogo kolichestva dannyh vysokogo kachestva chto sovmestno s bumom v razvitii vychislitelnoj tehniki pozvolilo sozdavat bolee realistichnye modeli V 1997 godu gruppa opublikovala pervuyu chislennuyu model metabolizma celoj gipoteticheskoj kletki Termin sistemnaya biologiya mozhet byt takzhe najden v state V Ziglgansberga i T Tolle opublikovannoj v 1993 godu V techenie 1990 h godov B Zeng sozdal ryad koncepcij modelej i terminov sistemnaya medicina aprel 1992 sistemnaya bioinzheneriya iyun 1994 i sistemnaya genetika noyabr 1994 V techenie 2000 h godov kogda sozdavalis instituty sistemnoj biologii v Sietle i Tokio sistemnaya biologiya vstupila v polnye prava buduchi vovlechyonnoj v razlichnye genomnye proekty obrabatyvaya i interpretiruya dannye iz omik proteomika metabolomika pomogaya v interpretacii prochih vysokoproizvoditelnyh eksperimentov vklyuchaya bioinformatiku Po sostoyaniyu na leto 2006 goda v svyazi s nehvatkoj sistemnyh biologov bylo sozdano neskolko uchebnyh centrov po vsemu miru Vazhnoj vehoj v stanovlenii sistemnoj biologii stal mezhdunarodnyj proekt Fiziom Eksperimentalnye metody sistemnoj biologiiDlya verifikacii sozdavaemyh modelej v sistemnoj biologii ispolzuyutsya razlichnye tipy eksperimentalnyh dannyh opisyvayushih kak otdelnye sostavlyayushie tak i sistemu v celom Zachastuyu v kachestve ishodnoj informacii dlya formulirovki gipotez i vyvodov ispolzuyutsya dannye poluchennye v drugih oblastyah biologii biohimii biofiziki molekulyarnoj biologii Tem ne menee sushestvuet ryad specifichnyh metodov prochno associiruemyh s sistemnoj biologiej Eti metody harakterizuet bolshoe kolichestvo eksperimentalnyh izmerenij a takzhe odnovremennoe detektirovanie mnogih harakteristik chto stalo vozmozhnym blagodarya poyavleniyu avtomatizirovannyh potokovyh metodik eksperimentov Primerami takih metodov mogut yavlyatsya Genomika vysokoproizvoditelnye metody sekvenirovaniya DNK vklyuchaya izuchenie v razlichnyh kletkah odnogo organizma Epigenomika Epigenetika izuchenie faktorov transkripcii ne kodiruemyh v DNK metilirovanie DNK i t d Transkriptomika izmerenie ekspressii genov ispolzuya DNK mikrochipy i drugie metody izmerenie vzaimodejstviya transkribiruemyh RNK Proteomika izmerenie urovnya belkov ili peptidov s ispolzovaniem dvumernogo gel elektroforeza mass spektrometrii ili mnogomernyh metodik izmereniya belkov Metabolomika izmerenie koncentracij tak nazyvaemyh malyh molekul metabolitov Glikomika izmerenie urovnya uglevodov izmerenie urovnya lipidov Krome predstavlennyh metodov izmereniya urovnya molekul sushestvuyut takzhe bolee slozhnye metody pozvolyayushie izmeryat dinamiku harakteristik vo vremeni i vzaimodejstvie mezhdu komponentami Interaktomika izmerenie vzaimodejstvij mezhdu molekulami naprimer izmerenie belok belkovyh vzaimodejstvij PPI izmerenie dinamiki potokov i koncentracij vo vremeni kak pravilo metabolitov sistemnyj analiz bioma Mnogie perechislennye metodiki v nastoyashee vremya vse eshyo aktivno razvivayutsya kak v napravlenii uvelicheniya tochnosti i informativnosti izmerenij tak i v sposobah chislennoj obrabotki poluchaemyh dannyh Instrumenty sistemnoj biologiiIssledovaniya v oblasti sistemnoj biologii chashe vsego zaklyuchayutsya v razrabotke mehanisticheskoj modeli slozhnoj biologicheskoj sistemy to est modeli skonstruirovannoj na osnove realnyh dannyh ob elementarnyh processah sostavlyayushih sistemu Metabolicheskij ili signalnyj put mozhet byt opisan matematicheski na osnove teorij fermentativnoj ili himicheskoj kinetiki Dlya analiza poluchennyh sistem mogut primenyatsya matematicheskie metody nelinejnoj dinamiki teorii sluchajnyh processov libo ispolzovatsya teoriya upravleniya Iz za slozhnosti obekta izucheniya bolshogo kolichestva parametrov peremennyh i uravnenij opisyvayushih biologicheskuyu sistemu sovremennaya sistemnaya biologiya nemyslima bez ispolzovaniya kompyuternyh tehnologij Kompyutery ispolzuyutsya dlya resheniya sistem nelinejnyh uravnenij izucheniya ustojchivosti i chuvstvitelnosti sistemy opredeleniya neizvestnyh parametrov uravnenij po eksperimentalnym dannym Novye kompyuternye tehnologii okazyvayut sushestvennoe vliyanie na razvitie sistemnoj biologii V chastnosti ispolzovanie ischisleniya processov avtomaticheskih sredstv poiska informacii v publikaciyah vychislitelnaya lingvistika razrabotka i napolnenie obshedostupnyh baz dannyh V ramkah sistemnoj biologii vedyotsya rabota nad sozdaniem sobstvennyh programmnyh sredstv dlya modelirovaniya i universalnyh yazykov dlya hraneniya i annotacii modelej V kachestve primera mozhno privesti rasshireniya XML dlya zapisi modelej a takzhe SBGN yazyk graficheskogo predstavleniya struktury vzaimodejstvij elementov biologicheskih sistem Sm takzheSmezhnye oblastiBioinformatika Biotehnologiya Bioinzheneriya Biostatistika Biofizika Biohimiya Vychislitelnaya biologiya Matematicheskaya biologiya Modelirovanie Sinteticheskaya biologiya Teoriya funkcionalnyh sistem FiziomPrimechaniya 1 Arhivnaya kopiya ot 1 iyunya 2016 na Wayback MachineThe pharmacology of pain signalling Curr Opin Neurobiol 1993 PubMed result Peter Kohl Denis Noble Raimond L Winslow amp Peter J Hunter Computational modelling of biological systems tools and visions angl Phil Trans R Soc Lond A zhurnal 2000 Vol 358 no 1766 P 579 610 ISSN 1364 503X doi 10 1098 rsta 2000 0547 Hiroaki Kitano Systems Biology A Brief Overview angl Science 2002 1 March vol 295 P 1662 1664 doi 10 1126 science 1069492 Sauer U et al Getting Closer to the Whole Picture angl Science 2007 27 April vol 316 P 550 doi 10 1126 science 1142502 PMID 17463274 Denis Noble The Music of Life Biology beyond the genome angl Oxford University Press 2006 ISBN 978 0199295739 p21 Kholodenko B N Bruggeman F J Sauro H M 2005 Mechanistic and modular approaches to modeling and inference of cellular regulatory networks Systems Biology Definitions and Perspectives Springer Verlag p 143 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite conference title Shablon Cite conference cite conference a Proverte znachenie daty date spravka Neizvestnyj parametr coauthors ignoriruetsya author predlagaetsya spravka Vikipediya Obsluzhivanie CS1 mnozhestvennye imena authors list ssylka Hodgkin A L Huxley A F A quantitative description of membrane current and its application to conduction and excitation in nerve angl angl journal 1952 Vol 117 no 4 P 500 544 PMID 12991237 Le Novere Le Novere N The long journey to a Systems Biology of neuronal function angl angl journal 2007 Vol 1 P 28 doi 10 1186 1752 0509 1 28 PMID 17567903 Noble D Cardiac action and pacemaker potentials based on the Hodgkin Huxley equations angl Nature journal 1960 Vol 188 P 495 497 doi 10 1038 188495b0 PMID 13729365 angl Systems Theory and Biology neopr Springer Verlag 1968 A Means Toward a New Holism angl Science Vol 161 no 3836 P 34 35 doi 10 1126 science 161 3836 34 Working the Systems neopr Data obrasheniya 4 fevralya 2010 Arhivirovano iz originala 16 aprelya 2012 goda Gardner TS di Bernardo D Lorenz D and Collins J J Inferring genetic networks and identifying compound of action via expression profiling angl Science journal 2003 4 July vol 301 P 102 1005 doi 10 1126 science 1081900 PMID 12843395 di Bernardo D Thompson M J Gardner T S Chobot S E Eastwood E L Wojtovich A P Elliot S J Schaus SE and Collins J J Chemogenomic profiling on a genome wide scale using reverse engineered gene networks angl Nature Biotechnology journal Nature Publishing Group 2005 March vol 23 P 377 383 doi 10 1038 nbt1075 PMID 15765094
