Трансмембранный белок
Трансмембранный белок — мембранный белок, который насквозь пронизывает липидный бислой, в котором он постоянно находится. Трансмембранные белки плотно закрепляются в мембране при помощи специального класса липидов, называемых . Многие из этих белков выполняют транспортную функцию, позволяя специфическим веществам пересекать биологическую мембрану, чтобы попасть внутрь клетки или же напротив, не давая им покинуть её пределов.
В водном растворе трансмембранные белки слипаются и выпадают в осадок. Для их экстракции требуется использовать детергенты или неполярные растворители, хотя некоторые из них (имеющие структуру ) можно экстрагировать, используя денатурирующие агенты. Все трансмембранные белки являются интегральными белками мембраны, но не все интегральные белки являются трансмембранными.
Классификация
По структуре
Существует два типа трансмембранных белков: белки, состоящие из альфа-спиралей, и белки, состоящие из бета-тяжей (β-бочонки). Альфаспиральные белки располагаются на внутренних мембранах клеток бактерий или в плазматических мембранах клеток эукариот, а также иногда в наружных мембранах бактерий. Это очень большая группа трансмембранных белков: у человека 27 % всех белков составляют альфаспиральные белки мембраны. β-бочонки встречаются только во внешних мембранах грамотрицательных бактерий, в стенках грамположительных бактерий и наружных мембранах митохондрий и хлоропластов. Все трансмембранные β-бочонки обладают сходной топологией, что может говорить об их общем эволюционном происхождении и сходном механизме укладки.
По топологии
Эта классификация основана на положении N- и C-концевых доменов и относится ко всем интегральным белкам мембраны. К I, II и III типам относятся белки, которые пересекают мембрану только один раз, а к типу IV относятся те белки, которые пересекают мембрану несколько раз. Трансмембранные белки I типа имеют N-концевую сигнальную последовательность и заякорены на липидной мембране при помощи последовательности остановки транслокации, которая как высвобождается транслоконом, таким образом, что две части белка остаются торчать по разные стороны мембраны. Они расположены таким образом, что их N-конец направлен в просвет эндоплазматического ретикулума в процессе их синтеза и транслокации (N-конец будет направлен во внеклеточное пространство, если зрелый белок расположен на плазмалемме). Белки II и III типа заякорены сигнальной якорной последовательностью, которая расположена не на конце, а внутри полипептидной цепи. Белки II типа направлены в просвет ЭР своим C-концом, а белки III типа N-концом. Тип IV подразделяют на IV-A, у которых N-конец направлен в цитозоль и IV-B, у которых N-конец направлен в просвет ЭПР. К V типу относятся интегральные белки, которые не являются трансмембранными и заякорены на липидной мембране при помощи ковалентно-связанных липидов. К типу VI относятся белки, которые имеют как трансмембранные домены, так и липидные якори.
Примечания
- Steven R. Goodman. Medical cell biology (неопр.). — Academic Press, 2008. — С. 37—. — ISBN 978-0-12-370458-0.
- Jin Xiong. Essential bioinformatics (неопр.). — Cambridge University Press, 2006. — С. 208—. — ISBN 978-0-521-84098-9.
- alpha-helical proteins in outer membranes include and certain lipoproteins Архивная копия от 20 октября 2012 на Wayback Machine, and others
- Almén M. S., Nordström K. J., Fredriksson R., Schiöth H. B. Mapping the human membrane proteome: a majority of the human membrane proteins can be classified according to function and evolutionary origin (англ.) // [англ.] : journal. — 2009. — Vol. 7. — P. 50. — doi:10.1186/1741-7007-7-50. — PMID 19678920. — PMC 2739160. Архивировано 24 ноября 2015 года.
- Harvey Lodish etc.; Molecular Cell Biology, Sixth edition, p.546
- Nelson, D. L., & Cox, M. M. (2008). Principles of Biochemistry (5th ed., p. 377). New York, NY: W.H. Freeman and Company.
Википедия, чтение, книга, библиотека, поиск, нажмите, истории, книги, статьи, wikipedia, учить, информация, история, скачать, скачать бесплатно, mp3, видео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, картинка, музыка, песня, фильм, игра, игры, мобильный, телефон, Android, iOS, apple, мобильный телефон, Samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Сеть, компьютер, Информация о Трансмембранный белок, Что такое Трансмембранный белок? Что означает Трансмембранный белок?
Transmembrannyj belok membrannyj belok kotoryj naskvoz pronizyvaet lipidnyj bisloj v kotorom on postoyanno nahoditsya Transmembrannye belki plotno zakreplyayutsya v membrane pri pomoshi specialnogo klassa lipidov nazyvaemyh Mnogie iz etih belkov vypolnyayut transportnuyu funkciyu pozvolyaya specificheskim veshestvam peresekat biologicheskuyu membranu chtoby popast vnutr kletki ili zhe naprotiv ne davaya im pokinut eyo predelov Shematicheskoe predstavlenie transmembrannyh belkov 1 odinochnaya transmembrannaya a spiral bitopicheskij belok 2 politopicheskij alfaspiralnyj belok 3 politopicheskij transmembrannyj b bochonok Membrana oboznachena svetlo zelyonym cvetom V vodnom rastvore transmembrannye belki slipayutsya i vypadayut v osadok Dlya ih ekstrakcii trebuetsya ispolzovat detergenty ili nepolyarnye rastvoriteli hotya nekotorye iz nih imeyushie strukturu mozhno ekstragirovat ispolzuya denaturiruyushie agenty Vse transmembrannye belki yavlyayutsya integralnymi belkami membrany no ne vse integralnye belki yavlyayutsya transmembrannymi KlassifikaciyaPo strukture Sushestvuet dva tipa transmembrannyh belkov belki sostoyashie iz alfa spiralej i belki sostoyashie iz beta tyazhej b bochonki Alfaspiralnye belki raspolagayutsya na vnutrennih membranah kletok bakterij ili v plazmaticheskih membranah kletok eukariot a takzhe inogda v naruzhnyh membranah bakterij Eto ochen bolshaya gruppa transmembrannyh belkov u cheloveka 27 vseh belkov sostavlyayut alfaspiralnye belki membrany b bochonki vstrechayutsya tolko vo vneshnih membranah gramotricatelnyh bakterij v stenkah grampolozhitelnyh bakterij i naruzhnyh membranah mitohondrij i hloroplastov Vse transmembrannye b bochonki obladayut shodnoj topologiej chto mozhet govorit ob ih obshem evolyucionnom proishozhdenii i shodnom mehanizme ukladki Po topologii Eta klassifikaciya osnovana na polozhenii N i C koncevyh domenov i otnositsya ko vsem integralnym belkam membrany K I II i III tipam otnosyatsya belki kotorye peresekayut membranu tolko odin raz a k tipu IV otnosyatsya te belki kotorye peresekayut membranu neskolko raz Transmembrannye belki I tipa imeyut N koncevuyu signalnuyu posledovatelnost i zayakoreny na lipidnoj membrane pri pomoshi posledovatelnosti ostanovki translokacii kotoraya kak vysvobozhdaetsya translokonom takim obrazom chto dve chasti belka ostayutsya torchat po raznye storony membrany Oni raspolozheny takim obrazom chto ih N konec napravlen v prosvet endoplazmaticheskogo retikuluma v processe ih sinteza i translokacii N konec budet napravlen vo vnekletochnoe prostranstvo esli zrelyj belok raspolozhen na plazmalemme Belki II i III tipa zayakoreny signalnoj yakornoj posledovatelnostyu kotoraya raspolozhena ne na konce a vnutri polipeptidnoj cepi Belki II tipa napravleny v prosvet ER svoim C koncom a belki III tipa N koncom Tip IV podrazdelyayut na IV A u kotoryh N konec napravlen v citozol i IV B u kotoryh N konec napravlen v prosvet EPR K V tipu otnosyatsya integralnye belki kotorye ne yavlyayutsya transmembrannymi i zayakoreny na lipidnoj membrane pri pomoshi kovalentno svyazannyh lipidov K tipu VI otnosyatsya belki kotorye imeyut kak transmembrannye domeny tak i lipidnye yakori PrimechaniyaSteven R Goodman Medical cell biology neopr Academic Press 2008 S 37 ISBN 978 0 12 370458 0 Jin Xiong Essential bioinformatics neopr Cambridge University Press 2006 S 208 ISBN 978 0 521 84098 9 alpha helical proteins in outer membranes include and certain lipoproteins Arhivnaya kopiya ot 20 oktyabrya 2012 na Wayback Machine and others Almen M S Nordstrom K J Fredriksson R Schioth H B Mapping the human membrane proteome a majority of the human membrane proteins can be classified according to function and evolutionary origin angl angl journal 2009 Vol 7 P 50 doi 10 1186 1741 7007 7 50 PMID 19678920 PMC 2739160 Arhivirovano 24 noyabrya 2015 goda Harvey Lodish etc Molecular Cell Biology Sixth edition p 546 Nelson D L amp Cox M M 2008 Principles of Biochemistry 5th ed p 377 New York NY W H Freeman and Company
